En el passat, els permisos eren concedits per les agències d’intel·ligència i seguretat, mentre que avui en dia la responsabilitat de la construcció o renovació d’edificis és responsabilitat dels governadors provincials. Segons els experts del moviment activista pels drets humans i la llibertat religiosa Solidaritat Cristiana a tot el món (CSW), la nova legislació ha complicat el procés, però la legislació continua sent discriminatòria perquè no s'aplica als musulmans sunnites. A més, la norma no s'aplica a grups religiosos com ara Ahmandi, Baha'is i comunitats xiïtes.
El president Abdel-Fattah al-Sisi ha convertit la llibertat religiosa i la defensa dels cristians en un dels eslògans de la seva pròpia política, alhora que ha acabat en l'objectiu de grups activistes per a nombrosos casos de violacions dels drets humans i una dura repressió de la dissidència interna. En el passat, moltes esglésies i cases de pregària es van construir de manera espontània, sense els permisos necessaris, atès que eren difícils d’obtenir.
La manca de permisos va resultar ser una font de controvèrsia o violència confessional en ser explotada per la majoria musulmana sunnita. I fins i tot en cas d’obtenir-ne una, els cristians han hagut de comprometre-se en diverses ocasions incloent esglésies sense campanes ni torres.
Els cristians majoritàriament coptes són una minoria substancial (10 per cent) a Egipte, un país amb majoria musulmana de gairebé 95 milions de persones. E 2016 i el 2017, es van dur a terme diversos atacs violents contra la comunitat cristiana. En relació amb els atacs, un tribunal militar va condemnar a 17 persones a mort; tanmateix, el puny de ferro de les autoritats no va servir per aturar la violència.
